MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIA01

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011367	AGA	2	6	75	80	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011367	ACG	2	6	89	94	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011367	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011367	TGG	2	6	229	234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011367	GGC	2	6	275	280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011367	ACCCC	2	10	328	337	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_011367	TGG	2	6	351	356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011367	TCC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011367	TAT	2	6	563	568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011367	CCG	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011367	GCC	2	6	641	646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011367	ATC	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011367	GGCGCC	2	12	788	799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011367	ACC	2	6	846	851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011367	ATC	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011367	CT	3	6	1726	1731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011367	CGGC	2	8	1757	1764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011367	TGA	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011367	CAC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011367	TCC	2	6	1857	1862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011367	TCC	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011367	CTT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011367	CGG	2	6	1997	2002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011367	CGGTGC	2	12	2027	2038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011367	TCA	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011367	CTT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011367	ACA	2	6	2805	2810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011367	TTC	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011367	CGG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011367	GGC	2	6	3031	3036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011367	GC	3	6	3077	3082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011367	GCAGG	2	10	3183	3192	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011367	CTT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011367	CGG	2	6	3258	3263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011367	GC	3	6	3344	3349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011367	CG	3	6	3352	3357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011367	GCC	2	6	3369	3374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011367	TGCG	2	8	3412	3419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011367	C	6	6	3443	3448	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_011367	CGG	2	6	3452	3457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011367	CGGGG	2	10	3855	3864	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011367	GGC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011367	GAC	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011367	CG	3	6	5537	5542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011367	T	6	6	5548	5553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011367	AAT	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011367	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011367	CAT	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011367	GTG	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011367	CTT	2	6	6424	6429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011367	GGC	2	6	6436	6441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011367	CCCG	2	8	6566	6573	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_011367	CGT	3	9	6615	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011367	AG	3	6	6640	6645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011367	AT	3	6	6671	6676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011367	GCG	2	6	6691	6696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011367	GATCC	2	10	6714	6723	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_011367	GC	3	6	6739	6744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011367	AGG	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011367	CGAA	2	8	6860	6867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011367	AT	3	6	6921	6926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011367	TGT	2	6	6970	6975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011367	ATC	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011367	AATTC	2	10	7017	7026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011367	TCT	2	6	7034	7039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011367	GAC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011367	TGA	2	6	7079	7084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011367	AAACC	2	10	7126	7135	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011367	AAT	2	6	8101	8106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011367	A	6	6	8358	8363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011367	A	6	6	8378	8383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011367	AAT	2	6	9469	9474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011367	GA	3	6	9488	9493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011367	TTA	2	6	9535	9540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011367	TATC	2	8	9563	9570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011367	A	8	8	11616	11623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011367	GTA	2	6	13017	13022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011367	A	7	7	13057	13063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011367	ATA	2	6	13107	13112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011367	TCT	2	6	13195	13200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011367	GCG	2	6	13207	13212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011367	TAT	2	6	14646	14651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011367	GTC	2	6	14678	14683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011367	CAC	2	6	17030	17035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011367	CAG	2	6	17059	17064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011367	TCG	2	6	17117	17122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011367	CCGC	2	8	17141	17148	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_011367	C	6	6	18570	18575	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_011367	ATG	2	6	18586	18591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011367	AT	3	6	18597	18602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011367	GC	3	6	21738	21743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011367	CG	3	6	21776	21781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011367	TG	3	6	21803	21808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011367	GC	3	6	22194	22199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011367	CG	3	6	22498	22503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011367	TTC	2	6	23187	23192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011367	CACCG	2	10	23243	23252	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_011367	GAC	2	6	23362	23367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011367	AAT	2	6	23373	23378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011367	ATG	3	9	23388	23396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011367	GCC	2	6	23400	23405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011367	CAG	2	6	23410	23415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011367	TTG	2	6	23444	23449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011367	GCA	2	6	23453	23458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011367	GC	3	6	23464	23469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011367	GAA	2	6	23492	23497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011367	CAT	2	6	23499	23504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011367	CACG	2	8	23541	23548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011367	CAG	2	6	23638	23643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011367	GC	3	6	23657	23662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011367	TCT	2	6	23684	23689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011367	CCCT	2	8	26168	26175	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_011367	AACA	2	8	26183	26190	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011367	CAT	2	6	26191	26196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011367	AAC	2	6	26211	26216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011367	GCA	2	6	26663	26668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011367	ACG	2	6	26673	26678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011367	ATCC	2	8	27213	27220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011367	CAG	2	6	27351	27356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011367	CGTC	2	8	27398	27405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.